于常海教授为推动祖国科学事业的发展，加强国内外学术交流，组织了54次国际学术会议，其中筹措在中国主办的国际学术会议有43次，架起了中国与世界科技联系的桥梁，使不具备出国条件的学术界同仁也能在国内及时分享国际最新的学术成果。
| 参与组织的专业会议 | |
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| 2018 | 主席，2018 Annual Global Biotech Summit- The Leading Biotech Conference in China: Opportunities in Biotechnology for Guangdong- Hong Kong- Macao Greater Bay Area (GBA) and the Global Markets, 2018粤港澳大湾区国际生物科技峰会及生物技术产业投资论坛，2018年9月20日-24日，香港+大湾区 |
| 2017 | 主任委员，北京神经科学学会胶质细胞及相关疾病专业委员会成立大会暨胶质细胞研究进展研讨会，2017年12月17日，北京 |
| 2017 | 主席，Hong Kong Biotech Horizon 2017 - Global Congress on Biotechnology: Diagnostics and Therapeutics, 2017年11月22日-25日，中国，香港 |
| 2017 | 主席，青年和平、科技创新步行及论坛，2017年8月12日-13日，中国，香港 |
| 2016 | 主席，第十二届国际脑能量代谢大会 (The 12th International Conference on Brain Energy Metabolism)，2016年5月25-28日，中国，香港 |
| 2016 | 大会组织委员会委员, 17th International Biotechnology Symposium，2016年，澳大利亚 |
| 2015 | 协办单位主席，"第二届中国生物计量发展研讨会"暨"生物标准化技术研讨会"，2015年11月6日-8日，中国，北京 |
| 2014 | 大会组委会主席，北京神经科学学会学术年会暨会员代表大会，2014年6月28日 ，中国，北京 |
| 2013 | 主席，Hong Kong Biotech Horizons – Translational Medicine: Promising Researches in Cancer Therapies and Diagnostics，2013年11月19日-21日，中国，香港 |
| 2013 | 会议组委会成员，中国神经科学学会第十届全国学术会议，2013年9月19日-22日，中国，北京 |
| 2013 | 分会主席，2013中国神经危重症高峰论坛，2013年5月25日，中国，北京 |
| 2013 | 副理事长、组织工作委员会主任，中国神经科学学会五届四次常务理事会，2013年4月13-14日，中国，杭州 |
| 2013 | 评审委员，中国神经科学学会2012年、2013年赛诺菲优秀学者奖评审会，2013年3月8日-9日，会议地点：中国，上海 |
| 2013 | 常务理事会副主席，港台青年交流促进会-主席会议，2013年1月2日，中国，香港 |
| 2012 | 副理事长、组织工作委员会主任，中国神经科学学会五届二次理事会，2012年12月8日，中国，苏州 |
| 2012 | 委员，2011-2012年神经变性病教育部重点实验室工作进展汇报会议及第五次学术委员会会议 (神经变性病教育部重点实验室学术委员会)，2012年11月23日-24日，中国，北京 |
| 2012 | 理事长、大会主席 (另一大会主席：邹丽萍)，2012年北京神经科学学会学术年会，2012年4月14日，中国，北京 |
| 2012 | 副理事长，中国神经学会五届二次常务理事会，2012年3月23日-24日，中国，北京 |
| 2011 | 学术委员会委员，神经变性病教育部重点实验室2010年-2011年进展汇报会议，2011年11月25日-26日，中国，北京 |
| 2011 | 主席，中国神经科学学会第九届全国学术会议，2011年7月29日-8月1日，中国，郑州 [其中：Synapse 1 (Chair: 王晋辉，于常海) 2011年7月31日15:45-17:45；Mini-symposium 14: Neuroglia (Chair: 段树民, 于常海) 2011年8月1日9:00-11:30；Plenary Lecture 6 (Chair: 于常海) 2011年8月1日14:00-14:45] |
| 2011 | 秘书长，第22届太平洋科学国际会议 - 7.2 Meeting the Challenges of Global Climate Changes in Infectious Diseases – Medical Virology, Diagnosis and Treatment 专题研讨会，2011年6月13日-17日，马来西亚，吉隆坡 |
| 2011 | 理事长，北京神经科学学会学术年会暨会员大会，2011年4月16日，中国，北京 |
| 2010 | 主席，第一届两岸四地研究生神经科学论坛，2010年8月20-22日，中国，北京 |
| 2010 | 副主席，港台青年交流促进会第四届常务理事会第五次会议，2010年8月11日，中国，香港 |
| 2010 | 科学委员会主任，第七届北京神经科学学会学术年会暨首都医科大学50周年校庆。2010年8月8日，中国，北京 |
| 2009 | 理事长，北京神经科学学会第六届理事会第四次会议，2009年10月31日，中国，北京 |
| 2009 | 组织委员会成员，国际神经化学学会2009釜山年会之台湾卫星会议—"神经退化性疾病治疗之新策略"，2009年8月30日-9月2日，台湾，台北 |
| 2009 | 秘书长，第11届太平洋科学届间会议“太平洋地区生命与健康”。2009年3月2日-6日，法属波利尼西亚，帕皮提 |
| 2008 | 主席，庆祝北京神经科学学会成立20周年暨韩济生院士从教55周年报告大会。2008年9月，中国，北京 |
| 2008 | 主席，第三届ISN神经化学专业学术会议暨第八届国际脑能量代谢大会 (The 3rd ISN Special Neurochemistry Conference - the 8th International Meeting for Brain Energy Metabolism)2008年6月，中国，北京 |
| 2007 | 秘书，第21届太平洋科学大会“人畜共患病和新生传染病”专题研讨会。2007年6月12-18日，日本，冲绳 |
| 2006 | 学术委员会主席(本地)，第五届亚太细胞生物学大会，2006年10月28-31日，中国，北京 |
| 2006 | 学术委员会委员，第七届国际脑能量代谢大会(7th International Conference on Brain Energy Metabolism) – Integrating Molecular, Cellular and Metabolic Aspects of Neuro-Glial Interactions。2006年8月15-18日，瑞士，洛桑 |
| 2005 | 学术委员会委员，中国神经科学学会第六届全国学术会议暨中国神经科学学会成立十周年庆祝大会,2005年10月13-17日，中国，重庆 |
| 2004 | 秘书长，2004全球华人生物科学家大会（10th SCBA International Symposium） 2004年7月18-24日，中国，北京 |
| 2004 | 主席，第六届国际脑能量代谢大会（6thInternational Meeting for Brain Energy Metabolism : Transporters, Mitochondria and Neurodegeneration） 2004年5月21-24日，希腊，克里特岛 |
| 2003 | 计划委员会成员，国际神经化学协会和亚太地区神经化学协会联合会议[Joint Meeting of the International Society for Neurochemistry (ISN) and the Asian Pacific Society for Neurochemistry (APSN)] 2003年8月，香港 (因SARS取消) |
| 2001 | 主席，香港科技大学校庆十周年国际神经科学会议暨中国神经科学学会第四届学术会议（The International Neuroscience Symposium for the 10thAnniversary of the Hong Kong University of Science and Technology and the Fourth Biennial Meeting for the Chinese Society for Neuroscience） 2001年7月29日 - 8月4日，香港 |
| 2000 | 组织委员会成员，中国生物化学药理学协会第七届年会（the Seventh Meeting of Chinese Biochemical Pharmacology Society） 2000年9月23-27日，中国，苏州 |
| 2000 | 计划委员会成员，局部缺血性脑损伤和保护机制论坛(Symposium on Mechanism of Ischemic Brain Injury and Protection) 2000年1月20-22日，中国，上海 |
| 1999 | 组织委员会，第3届中国神经科学协会学术双年大会（Third Biennial Meeting of The Chinese Society for Neuroscience） 1999年10月5-9日，中国，北京 |
| 1998 | 组织委员会副主席，第1届中国及亚太地区药用产品注册的技术要求研讨会（First China & Asia-Pacific Symposium on Technical Requirements forw Registration of Pharmaceutical Products in China & Asia-Pacific Region） 1998年1月11-13日，香港 |
| 1997 | 组织及计划委员会主席，北美医学协会基金会国际会议（第4届斯坦福国际神经科学论坛），关于对帕金森症和其它神经障碍的细胞和基因疗法（North American Medical Association Foundation International Meeting : Cell and Gene Therapy in Parkinson's and Other Neurological Disorders）1997年10月9-13日，中国，北京 |
| 1997 | 组织委员会成员，第2届中国神经科学协会学术双年会议（Second Biennial Meeting of The Chinese Society for Neuroscience） 1997年10月15-19日，中国，西安 |
| 1996 | 科学委员会成员，第3届亚太地区神经化学协会会议（the Third Meeting for the Asian Pacific Society for Neurochemistry） 1996年10月8-10日，中国，北京 |
| 1995 | 组织和计划委员会主席，第3届斯坦福国际神经科学论坛，信号传导和基因表达中的神经功能障碍（Third Stanford International Neuroscience Symposium, Signal Transduction and Gene Expression in Neurologic Disorders） 1995年10月12-15日，中国，上海 |
| 1995 | 组织委员会，第1届中国神经科学协会学术双年会议（The First Biennial Meeting of the Chinese Society for Neuroscience） 1995年10月15-19日，中国，上海 |
| 1995 | 组织委员会主席，香港科技大学理学院开放日（Sciences in HKUST, School of Sciences, HKUST），香港 |
| 1995 | 计划委员会，第26届美国神经化学协会年会（26th Annual Meeting of American Society for Neurochemistry ） 1995年3月，美国加利福利亚州，圣莫尼卡 |
| 1993 | 组织和计划委员会主席，第2届斯坦福国际神经科学论坛，中枢神经系统的基因表达（Second Stanford International Neuroscience Symposium : Gene Expression in the CNS） 1993年10月19-22日，中国，北京 |
| 1992 | 组织委员会，国际神经药理学论坛，临床应用中的神经化学（International Neuropharmacology Symposium: Neurochemistry in Clinical Applications） 1992年9月9-11日，中国，广州 |
| 1991 | 组织和计划委员会主席，斯坦福百年论坛，神经元和星形胶质细胞的交互作用：病理学含义（Stanford Centennial Symposium, Neuronal-Astrocytic Interactions : Pathological Implications） 1991年7月9-13日，香港 |
| 1990 | 计划委员会，第21届美国神经化学协会年会（21st Annual Meeting of American Society for Neurochemistry） 1990年3月4-9日，美国亚利桑那州，凤凰城 |