于常海教授在多年的科学研究工作中，重点专注于对神经系统的星形胶质细胞的研究以及生物科技的应用开发，在科学理论和实践应用方面均取得了多项开创性的成果。与此同时，他不忘一个科学家对社会所应负起的责任，在科技成果服务于社会方面也做出了许多积极的贡献。

• -神经生物学研究： 脑中神经元兴奋递质 -谷氨酸的系统研究，星形胶质细胞在代谢损伤和机械损伤等病理状态下的变化和机制研究，脑中新基因、蛋白的发现与研究，新型的分子生物学检测技术的开发。
• -生物科技的应用开发： 增强型 real-time PCR（ERT-PCR）的研究，传染性疾病基因检测的研究开发，基因芯片的开发。

目前在国家自然科学基金和国家重点基础研究发展计划（973计划）的资助下，正在进行的课题包括：

1、内吞在激活的星形胶质细胞肥大过程中的作用（国家自然科学基金资助项目 2012-2015）；

2、以星形胶质细胞为靶点阐明慢性疼痛机制：DREAM信号通路的研究（国家自然科学基金资助项目 2011-2013）；

3、中枢神经损伤修复与功能重建中胶质细胞的作用及意义（国家重点基础研究发展计划，973计划）。